Es gibt Krankheitserreger, die durch Tröpfcheninfektion oder durch die Aufnahme von Nahrung erst in den Mund und anschließend in den Magen gelangen. Diese Erreger beenden ihren Weg meistens hier denn das Säurebad tötet die Bakterien in der Regel ab. Einige Keime überwinden jedoch diese Barriere und gelangen in den Darmtrakt. Hier ist nun wichtig, wie gut das Immunsystem darauf reagiert.